《孤岛危机2》在游戏内容上与一代也有很大变化,已经从秘密的丛林作战转向了公开、大规模的现代城市战争。故事发生在距一代3年后的2023年。外星人在地球上的大片区域挑起了战争,各大城市都遭到攻击,人口锐减,玩家将要进行捍卫地球的末日战争。
孤岛危机的野战地图一般都较为庞大,这种地图的优势是地形也比较复杂,容易设立一些次要任务,可通过多条不同的道路抵达同一个地点,敌我双方交火距离可以适当拉长,大约可保持在300米以内,体积较大的载具也容易行驶和作战。
交战的规模和场面都比较大,二代改成城市作战以后,地图的面积大大缩小,次要任务也被取消,玩家在行进道路上的选择权也被剥夺,敌我双方的交火距离集中在100米以内,在宣传片中大肆宣传的垂直作战大多体现在跳跃各种公路的断层和破损的房屋,在作战中并没有太多作用,一些像主战坦克、防空车的重型载具也没有出现,只有吉普和步兵车在少数关卡中露面,缺乏原作野外坦克作战的辽阔场面,不得不用楼房倒塌、桥梁断裂等情景进行弥补。
虽然优秀的武器大致是随着任务的深入而逐步出现,但比较奇怪的是在最后几个关卡中一些在中期比较好用的枪支反而不见踪迹,比如mk60班用机枪、豺狼散弹枪等,高斯枪出现的次数也不多。