从车间的侧门走到废铁场(Junk yand),跟着那只狗就会遇到Douglae,在那边可买到不同的道具,还可以取得避难所的情报。这时听到一声惨叫,Douglae说是来自杂货铺那边,但那边是锁住的,唯有从古井那边过去。Aya跟着Douglae的狗去拿绳子,用来落下在Driveway的井底。在井底会于到一只透明的怪物,十分难打(小心)。 通过地道到达杂货铺的后门,可先解除门锁到外边SAVE。从杂货铺的侧门走到Back Street,走到那间有怪物的废屋,但是那里的门被锁住了,Aya 唯有到房间Warehouse看看,在房间里发现柜是可打开的,但是无(士巴拿)。找Douglae帮手,他说在Garage的右上方的架上有(士巴拿),取得后返回房间,使用(士巴拿)打开到达隔离的房间,在那里会遇到上一关的BOSS,再次与他决战。
BOSS倒下时发出刺耳的叫声,Aya受到刺激而晕倒。 醒来时遇到Kyle,并与他一起上路,正当大算乘车离开时,车子已被怪物破坏了。去找Douglae,向他说「車を貸して」,便会得到Lobby的锁匙(ロビ-の鍵)。到Lobby的收银机输入密码(3033),就可以取得万用锁匙。这个密码可从1、2号房及Lobby中的图画推断出来。进入2楼的Loft,可以取得空的汽油罐,在夹万中输入(4487),便可取得令水魔法提升一级的道具。到Gas Station注入汽油,再交给在Garage的Douglae,他说车子要修理,叫Aya到Room 6休息。休息后便会与BOSS战斗,所以建议先 SAVE。
战胜后在Main Street中找到Douglae,便可得到他的车匙,再到 Garage,会看见Kyle,他说出一些关于线粒体的事,之后二人向着避难所出发。 2000年9月6日 12:06分 Mine
Aya及Kyle二人到达避难所后,不幸受到怪物的围攻,Kyle更受伤了,Aya 只好一人应战,打倒大概十来只的怪物后便可向矿洞进发,如果不敌的话也可先进入去暂避。入到矿洞后却开不到Kyle。
一直向前走,在Gorge中发现路轨断了,再走到Forward Tunnel开动矿车,走到尽头拿走木板,铺在上面便可通过。走到Refuge,在尽头发现打开门的机器,先拿走最下面的 Jumper(ヅャソバ-),然后装到第二个电路上,再开左下方的电源,便可成功打开两道门。再到Cavern,会看到中BOSS。战后,原本门是开了,但不知为何电源被切断了,于是返回Refuge再次接线。今次只要将Jumper放在第一和第四个位置,在门旁边的电车上选「スィツチを押す」便可打开门。
通过Secret Passage到达避难所的Elevator Hall,途中会有武器弹药库,可以补给弹药。然后一直走到Sterlizayion room,Aya会再次想起以前的事......利用转角的电梯到达B2 Shelter。Aya的目的地是B2F的处置室,但那里的门却锁住了,需要card key才能开启。返回B1 Shelter的消毒除去室,突然会有消毒气体喷出,而两边的门也锁上了,这时先调查南面的门旁边的对话机,要求对方关掉装置,但对方却没有理会,Aya唯有到刚才进入的门旁边的垃圾桶,那桶是用来废弃消毒服的,虽然跳下去会有一定的危险性,但这时也不容细想了。
跌下后向前走会与BOSS战斗。战后向前走,如果刚才按到制的话,调查大门两次便可进入Incinaerator Control Room。在里面看到Kyle了,二人便一起行动。到达水库时输入密码18便可开启,进入Reservoir时向左面的门走,走到一部电梯前,利用这部电梯可返回B1F。这时Kyle说不如分开行动,并将一张card key交给Aya,这样便可以解除B2处置室的锁了。通过处置室到研究室,看到两个实验箱,上面的名字竟然写着Aya和Eve......在房间的手提电脑中输入「A3EILM2S2Y」,然后电脑会随机问玩者三条问题,必须全部答对(看下面)。
随后,Aya问了电脑一些关于今次事件及ANMC的情报,然后电话响起,原来是Kyle打来,他将着里的地图传送给Aya。在走廊A中会遇到一只怪物,打倒后取得card key,可以开启Elevator Hall另一边的门锁。