基本准则
每关一定要把所有俘虏及乘物带过关。因为过关后每名俘虏奖1000分，而乘物则加100000分！ 对于敌方机械兵器，包括坦克、装甲车、飞机以至关底BOSS，尽量用机枪否手枪打而不要用手雷，更不要用炮。由于此游戏的记分方法比较特别，不象一般的射击游戏，击毁一辆坦克给你一定的固定分，而是以击中敌方的枪数记分。不论是手枪、H枪、S枪，击中敌人一枪一律100分，击毁为止。（F、R枪记分较特别，但总的也是按枪计分）。因此，对于想拿高分的玩家来说，用S枪是最不值的，因为S枪的威力最大。消灭同一个敌人，S枪如果得100分，用手枪就可能就是600分。总之，威力越大的武器越不利于挣分。因此，在有乘物时应尽量用枪打而避免用手雷及炮弹。
有条件用刀砍死的敌人，以及捆绑俘虏的绳索，尽量用刀砍。因为砍中敌人一刀是300分（一代为300分），而打中一枪是100分。一定要注意安全，但是如果为了用刀击毙敌人而丢了性命还是不值得的。
以上三点是获取高分的基本准则，下面将各关中的隐藏分数及技巧加以披露。
MISSION 1
在一开始不多久有一名骑骆驼的敌人，对付他最好用枪打掉他的刀，再爬过去砍死他，可得4000多分。就在此处向最高的一棵树开枪，有一串香蕉及两名俘虏。 走到前面有三个炮塔，这里最重要一开始时一定要让发气功的人质在最左边（为了等下拖掉他），打这三个塔时先打放出来的炮弹，等到没时间时再一个一个干掉先干掉左边的二个，然后再打最右边的那个，记住一干掉这个就要赶紧向前跳。这样就可以把这个人质拖掉，把人质拖掉后，然后打后面的导弹车时人质就不会防止你得分了。
打导弹车要坐着骆驼打它放出来的导弹这个要多多练习。等打到8秒钟时就赶紧向前冲。一直冲到过关才会加时间。 在本关BOSS出现前有五架直升飞机的编队，不要将他们一一击落，只需将为首的红色直升飞机击落，后面几架均会自行撞毁，并且共可获得150000的分数。为取得最高分，也可将后四架飞机打至快爆时在击落红色领头飞机。
不过一定要注意可别打得过火而因小失大。 在本关关底，两侧机翼下的发动机是有奖分的。取得他们的较好方法是先站在右翼下向上对着发动机猛开枪，同时注意干掉左侧跳下来的敌人。当右翼发动机出现10000的字样后，马上打左翼的发动机，用手雷干掉右翼跳下来的敌人，即可得50000分。在关底多拖一点时间可拖出一名俘虏。 本关的俘虏总数为11人，过关奖分（加上乘物）330000。
MISSION 2
此关隐藏的秘密最多。首先在一进去的第一名俘虏处，向上方石像左边的眼睛开枪，可得宝石一枚，至于是100分还是30000分就看你的运气了。在水边将骆驼放掉，它能帮你撞死正前方的敌人，然后向前走绕到上面跳下来的敌人背后用刀捅死他们。在此之前不要向木桶开枪。干掉他们后跳上木桶，垂直起跳至最高点时向右开枪，有两名俘虏。进入墓穴后，在一道大铁丝网门架处跳起向上开枪，有一名俘虏。对于此关的木乃伊，如前所述最好全部用刀砍死（有几个实在难度太高也只好作罢）。此名俘虏的上方有一名给你[H]枪的俘虏，从这里再向前走两步，背景里有一个较暗的石像（模样同本关开始那个差不多）。向他右边的眼睛开枪可得一宝石。 在进入一道闸门后，前方有一名背着旅行包的女孩，开枪打漏她的背包，会漏下三样宝物，对于此女孩一定要过去撞倒她，不要等她自己走到头敬个礼跑掉，因为她在过关后算一名俘虏（10000分）。
在打死一个吐滚珠的木乃伊后，右方有一具死尸，先用机枪向他开49枪再去捡50000分的宝石，吃完后注意马上离开。再往后会有一名拿着放大镜的考察者，等他变成木乃伊后打死它，可得一宝石。从这里向上走有一处落石，此处应一直冲过去，不但没有危险，而且可以得到奖分。此奖分若为狒狒，则是1000分，若为宝箱则有60%的几率为30000分。再向上走有一个从地面向上喷出毒雾的地方，喷口处有一个宝箱，不要不吃，它有50%的几率是30000分。方法是趁它喷完两条毒雾后马上走下去并一直向前冲，可保无恙。
当然即使在此处被变成木乃伊也不可怕。再向左走，有一处需向上跳四级的地方，在第三级最边上向右跳，可进入一条秘道，这里有两个宝箱，再向右方走并跳上一个带角的石像，开枪打开右边的宝箱，等大约五秒钟神灯变为灯神后跳过去，可得大把金币。在此处上方有一神灯，为避免直接吃掉它而仅得10分，较好的方法是站着向上开九枪（此时最好别拿F或S枪）然后向左边的石像跳，跳起的瞬间向上开第十枪。此时神灯落下而你已跳至对岸。第二个神灯变成灯神的时间比第一个略短，要注意。在接近关底处，即有大批木乃伊钻出来的地方，墙上有一块刻着眼形图案的砖石，对它开枪可得九枚宝石。 此关俘虏总数为14人，关底加分360000分。
MISSION 3
对于此关及以后拿着盾牌的敌人，最好在远处用枪打掉他们的盾牌，每人可得3000分左右。在本关中途有一处需从第一列火车跳至第二列，在这里向第一列火车头的烟囱处开枪，可救出三名俘虏，跳车时如果在第二列火车向右运动至最远点时你跳过去，即可得50000奖分。只要多多练习，掌握好跳跃时机就能安全跳过去了。 在走过车箱后就有飞机坐了，飞机边上二个拿挡牌的士兵不要干掉，用飞机去压它们的挡牌，每个士兵可以得10000多分。注意压的时候不要太走前了，因为前面就是一辆导弹车了。
这辆导弹，又是挣分的最好机会。让它放出导弹来，然后用飞机上的机枪去打。打到8秒钟再向前冲，至到过关才有时间加。 在本关BOSS处，会有一女孩出现，不要忘了撞倒她。如果你同BOSS周旋足够长时间的话，会有两名俘虏出现。劲量靠近BOSS这样它会放出一些导弹来，用枪打，有分，出来一次大概可挣2000分。 本关俘虏总数16人，关底加分380000分。
MISSION 4
一开始处那个穿西装的人的箱子可别忘了拿（500分）。向前走就是一些房子了里面有很多东西。记住地面的第三辆车子千万不打掉。是为了后面养鸡用的：）。跳过第三辆车后有一间大房子打掉后里面有二只鸡，千万不吃掉呀。还有前面的一个拿挡牌的士兵不要去打。你可以在打掉那间房子后跳到一个盒子上这样鸡就在下面走来走去的生蛋。这时让它们去不要去管，你可以去休息一下了等到8秒钟时赶紧把它们给吃掉然后向前冲到一辆双层巴士前就有时间加了。
在打过一辆双层巴士之后有一处需向下跳，跳下去后在悬崖边向上开枪，有三名俘虏和一个DIET（减肥剂）。向前走有二只船，用机枪打掉一只然，第二只就不要打了在这里可以跳起来用刀砍士兵，前面的那只船最好不要砍，因为会从后面出来一士兵扔手榴弹，很容易去命。在砍士兵时要注意上面拿着挡牌的士兵就是了，打一段时间后发气功的人质会帮你打掉那只船这时你就可以向前走了。 在坐到坦克后一定要向前冲，在冲的时候不要忘了救人质，因为这时的时间是要留到后面来打导弹车的。在前面有二辆导弹车，先快速的用机枪打掉一辆后，然后让后面的一辆放导弹，你用坦克里的机枪打放出来的导弹。注意角度要向上打。等到打到3秒钟后就赶紧向前冲。到过关就有时间加。 在此关关底处拖时间，有三名俘虏。 此关俘虏总数17人，关底加分390000分。
MISSION 5
本关一开始，第一和第三辆轿车上方分别有500分和30000分，应先跳起干掉第四辆车周围的小兵后再跳上第三辆车，跳着向下开枪。当小车被炸得飞起最高点时向上跳，即可得到那30000分的宝石。 在次关街道的末尾，一个大斜坡前，最后一幢房屋侧面的阳台处有三名隐藏俘虏。在斜坡边有一棵大树，向上开枪可得6枚果。在这里开枪干掉铁道上的两名小兵后一点一点向前走将右方的隧道口引出来，千万不要走得太急而把那辆吐滚珠的装甲车引出来。隧道口出后，站上斜坡跳起向右方隧道边墙开枪，有三名俘虏。
进入隧道后的女孩要撞倒，有可能有十几万的分。此处有一队与第一关一样的直升飞机编队，打法同前。在打第一列冲过来的火车时，站在标有“5”的柱子下向上方的红灯开枪，有三名俘虏。在隧道尽头，铁道拐弯的地方向上开枪，亦有三名俘虏。本关打那堆形似“不知火幻庵”的东西时，应用枪打不要用Metal Slug轧死它们，因为轧死它们是没有分的，最好大多数全用刀砍死（不过危险性较大）。 打完这些东西后会有一辆吐滚珠的战车出现，就在它左方不远处约一人高的地方有一条像自来水水管的管道，在管道打弯处有一名俘虏，最好是跳出Metal Slug用S枪，一枪即可打出，而用Metal Slug的机枪则不太好瞄准该点。后面跳上台阶后等坦克过来后就到最左边用机枪打，这里会有大量的坦克出现，直至打光为止。 过关时最好全都用机枪打。不要扔手榴弹，或放炮弹。本关俘虏总数为19人，关底加分410000分。
MISSION 6
在本关开始有一处站满了扔小火箭的敌兵的地方，打法：先把下面的沙包打掉，然后跳到下面的油箱上，下去后看见前方的士兵马上跳回最左边的岸上向右边开枪即可安全通过。此地有一灯塔（上面站着一名持火箭筒的敌兵），在灯塔下向上开枪，有一名俘虏。在后边的大吊桥前，有一个标着箭头的牌子，向它开枪，有一名俘虏,过大桥要多用手雷，边跳边扔手雷（要多多练习）。在敌人基地内部，消灭掉最后一辆坦克后（吃完F枪和手雷不久），在大批外星人出现前，应有一处空地，在此处向上开枪（如果F枪则需跳起向上开枪）有一名俘虏。向前走，有一处最高点吊着一名俘虏，就在他右方的铁架子处向上开枪，有两名俘虏。（一名在铁架处，另一名在他左边一点的最高处）。
在本关倒数第二个标有“02”的大铁门右方，有一个长方形小凸起。在干掉此处的外星人后向它开枪，有一名俘虏。 本关俘虏总数为18人。 以上就是合金弹头2的高分攻略。另外有一个“无赖赚分法”，用此法可以使总分变为无数。方法是，在最后一关倒数第二批棕色外星人处，不要干掉站在架子上的敌人，让他们一直发子弹，然后蹲在下面用刀砍掉这些子弹，直至耗到TIME OVER。此法挣分极快，耗完一条命约可得500000到600000。不过这方法太无聊也太无赖，不提倡使用。 本关的BOSS打法就是不要让其中的飞行物出来即可。所以在本关一定要准备好大量的手榴弹。最终BOSS快出来时要先跳到小房子上，先后解决小BOSS。在一开始时，先用枪打一阵子，等到小飞行物一出来就赶紧跳起来用手榴弹把它们解决。否则你会死的很难看！只要拖到坦克来了，就赶紧跳进坦克，然后开到最上面用坦克里面的炮弹，炸，出来一个死一个，不一会儿就可以过关了，坦克千万不要干掉了。
结局画面
