1、统率：武将基本的三项能力(俗称“三围”)中，原本的“速度”变成了“统率(とうそつ)”。统率不但与攻击顺序有关，还影响物理伤害值，即对实际攻防有一定的加成效果：武将的统率越高，给与敌方的物理伤害就越大，同时受到的伤害越小。
2、猛将：武将能力界面下，武器(ぶき)项右侧带有☆号的即为猛将，如：赵云、魏延、张郃等。他们在装备一般武器时，每回合就能进行2回攻击，而在装备了特殊道具“兵书24篇”时更是能进行4回攻击，不过在装备连打武器的情况下依旧是进行2回攻击。
3、兵士数：敌我双方兵士数大幅增加。当我方兵力在1万以上时，造成物理伤害按1万计算，1万以下则与原版2代一致。敌方兵力在65536以上时，造成物理伤害按65535计算，另外敌方的攻、防会随着兵力的减少，有一定的增加。
策略
1、军师：军师排在队列前五位时便可参加战斗，且只关系到我方所能使用的策略种类(不同类型军师所掌握的具体计策阵型种类，可参见文末附表“军师类型”)；
2、SP值：队伍的实际SP值以及使用智复丹所恢复的SP量皆由我方全队的智力总合所决定，故建议队列中不参战的两人，尽量选择高智力的文官，以提高整体的智力水平；
3、计策：引入了初代中的击柔、倍击、归还3种计策，最强的攻击计策变为落雷计；火、水、石三系的攻击计策以及回复计策的效果较原版有所增强，而敌方计策攻击的伤害值约为我方的2-3倍；另外、敌方中离间、离叛计自相残杀时的伤害锐减(计策的具体效果等参见文末附表“计策一览”)；
兵粮
本作引入了初代中的兵粮系统并加以强化：兵粮在行军时会逐渐消耗，具体数值与行军时的地形有关，兵士数越大消耗量也越大，当兵粮降至0时，每走一步兵士数都会减少，需要注意的是乘船时兵粮亦会消耗；另外，兵粮在战斗中也会消耗，消耗量与我方的兵士数有关，而不同路线的消耗倍率也不同：隐藏>荆州>伐吴>汉中，一旦被火、水系的计策命中后更是会锐减，当兵粮减少到0时，给与对方的伤害将下降为原本的1/2(这一设定也适用于敌方)。
要增加兵粮只能在城池、关隘中的兵粮屋购买，兵粮屋的招牌是“兵”(有少部分为“下”甚至没有招牌，此为bug)，金：兵粮=1：10。
